Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms