Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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