Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms