Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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