Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph3bQ9DA80 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms