Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms