Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms