Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms