Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot8Q9D8X5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms