Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms