Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms