Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsraQ9D6Y7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms