Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Borcs6Q9D6W8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms