Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms