Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm3404Q9D506 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm3404Q9D506 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm3404Q9D506 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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