Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms