Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D4W2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms