Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D454 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D454 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D454 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms