Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Krt20Q9D312 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms