Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms