Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms