Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1F3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms