Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms