Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap1Q9D0M1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prpsap1Q9D0M1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms