Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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Zbed3Q9D0L1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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