Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NkapQ9D0F4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms