Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mms19Q9D071 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Mms19Q9D071 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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