Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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