Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr3eQ9CZT4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr3eQ9CZT4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms