Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms