Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nde1Q9CZA6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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