Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gins3Q9CY94 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms