Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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