Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWS1

Rnf135, E3 ubiquitin-protein ligase RNF135, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf135Q9CWS1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Rnf135Q9CWS1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Rnf135Q9CWS1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf135Q9CWS1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf135Q9CWS1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf135Q9CWS1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf135Q9CWS1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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