Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ndufb9Q9CQJ8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ndufb9Q9CQJ8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ndufb9Q9CQJ8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ndufb9Q9CQJ8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ndufb9Q9CQJ8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ndufb9Q9CQJ8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ndufb9Q9CQJ8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ndufb9Q9CQJ8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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