Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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