Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms