Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms