Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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