Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sike1Q9CPR7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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