Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms