Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl1Q99N96 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl1Q99N96 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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