Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpgs1Q99MS8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpgs1Q99MS8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpgs1Q99MS8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpgs1Q99MS8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs1Q99MS8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms