Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms