Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clcc1Q99LI2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clcc1Q99LI2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clcc1Q99LI2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clcc1Q99LI2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clcc1Q99LI2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clcc1Q99LI2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clcc1Q99LI2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Clcc1Q99LI2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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