Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnpo2Q99LG2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnpo2Q99LG2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms