Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms