Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SardhQ99LB7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SardhQ99LB7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SardhQ99LB7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SardhQ99LB7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SardhQ99LB7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SardhQ99LB7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SardhQ99LB7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms