Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps4Q99KG7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms