Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SmagpQ99KC7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms